Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SRGAP3O43295 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRGAP3O43295 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SRGAP3O43295 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SRGAP3O43295 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SRGAP3O43295 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SRGAP3O43295 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SRGAP3O43295 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SRGAP3O43295 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SRGAP3O43295 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SRGAP3O43295 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SRGAP3O43295 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SRGAP3O43295 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SRGAP3O43295 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SRGAP3O43295 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRGAP3O43295 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SRGAP3O43295 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SRGAP3O43295 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SRGAP3O43295 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SRGAP3O43295 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SRGAP3O43295 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRGAP3O43295 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRGAP3O43295 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SRGAP3O43295 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SRGAP3O43295 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SRGAP3O43295 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SRGAP3O43295 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SRGAP3O43295 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SRGAP3O43295 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRGAP3O43295 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SRGAP3O43295 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SRGAP3O43295 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SRGAP3O43295 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms