Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP26A1O43174 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP26A1O43174 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP26A1O43174 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP26A1O43174 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP26A1O43174 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP26A1O43174 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP26A1O43174 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP26A1O43174 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP26A1O43174 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP26A1O43174 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP26A1O43174 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP26A1O43174 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP26A1O43174 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP26A1O43174 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP26A1O43174 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP26A1O43174 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26A1O43174 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP26A1O43174 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP26A1O43174 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms