Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
FANCAO15360 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
FANCAO15360 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
FANCAO15360 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
FANCAO15360 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
FANCAO15360 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
FANCAO15360 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
FANCAO15360 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
FANCAO15360 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
FANCAO15360 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
FANCAO15360 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
FANCAO15360 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
FANCAO15360 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
FANCAO15360 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
FANCAO15360 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
FANCAO15360 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
FANCAO15360 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
FANCAO15360 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
FANCAO15360 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
FANCAO15360 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
FANCAO15360 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
FANCAO15360 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
FANCAO15360 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
FANCAO15360 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
FANCAO15360 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
FANCAO15360 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
FANCAO15360 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
FANCAO15360 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
FANCAO15360 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
FANCAO15360 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
FANCAO15360 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
FANCAO15360 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
FANCAO15360 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
FANCAO15360 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
FANCAO15360 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
FANCAO15360 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
FANCAO15360 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
FANCAO15360 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
FANCAO15360 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
FANCAO15360 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
FANCAO15360 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
FANCAO15360 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
FANCAO15360 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
FANCAO15360 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
FANCAO15360 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
FANCAO15360 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
FANCAO15360 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
FANCAO15360 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
FANCAO15360 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
FANCAO15360 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
FANCAO15360 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
FANCAO15360 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
FANCAO15360 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
FANCAO15360 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
FANCAO15360 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
FANCAO15360 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
FANCAO15360 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
FANCAO15360 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.97■■■■■ 4.31
FANCAO15360 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCAO15360 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCAO15360 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
FANCAO15360 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
FANCAO15360 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
FANCAO15360 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
FANCAO15360 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
FANCAO15360 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCAO15360 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCAO15360 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCAO15360 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCAO15360 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.89■■■■■ 4.3
FANCAO15360 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
FANCAO15360 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
FANCAO15360 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
FANCAO15360 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
FANCAO15360 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCAO15360 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCAO15360 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
FANCAO15360 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
FANCAO15360 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
FANCAO15360 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
FANCAO15360 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
FANCAO15360 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
FANCAO15360 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
FANCAO15360 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
FANCAO15360 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
FANCAO15360 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
FANCAO15360 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
FANCAO15360 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCAO15360 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCAO15360 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCAO15360 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCAO15360 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
FANCAO15360 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
FANCAO15360 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
FANCAO15360 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
FANCAO15360 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
FANCAO15360 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
FANCAO15360 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
FANCAO15360 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
FANCAO15360 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms