Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM24O15164 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM24O15164 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM24O15164 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM24O15164 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM24O15164 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM24O15164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM24O15164 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms