Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CITO14578 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CITO14578 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CITO14578 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CITO14578 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CITO14578 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CITO14578 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CITO14578 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CITO14578 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CITO14578 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CITO14578 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CITO14578 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CITO14578 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CITO14578 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CITO14578 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CITO14578 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CITO14578 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CITO14578 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CITO14578 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CITO14578 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CITO14578 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CITO14578 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CITO14578 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CITO14578 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CITO14578 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CITO14578 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CITO14578 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CITO14578 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CITO14578 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CITO14578 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CITO14578 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CITO14578 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CITO14578 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CITO14578 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CITO14578 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CITO14578 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CITO14578 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CITO14578 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CITO14578 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CITO14578 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CITO14578 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CITO14578 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CITO14578 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CITO14578 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CITO14578 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CITO14578 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CITO14578 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CITO14578 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CITO14578 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CITO14578 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CITO14578 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CITO14578 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CITO14578 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CITO14578 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CITO14578 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CITO14578 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CITO14578 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CITO14578 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CITO14578 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CITO14578 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CITO14578 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CITO14578 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CITO14578 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CITO14578 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CITO14578 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CITO14578 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CITO14578 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CITO14578 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CITO14578 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CITO14578 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CITO14578 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CITO14578 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CITO14578 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CITO14578 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CITO14578 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CITO14578 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CITO14578 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CITO14578 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CITO14578 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CITO14578 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CITO14578 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CITO14578 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CITO14578 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CITO14578 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CITO14578 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CITO14578 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CITO14578 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CITO14578 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CITO14578 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CITO14578 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CITO14578 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CITO14578 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CITO14578 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CITO14578 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CITO14578 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CITO14578 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CITO14578 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CITO14578 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CITO14578 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CITO14578 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms