Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCRL2O00421 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCRL2O00421 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCRL2O00421 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCRL2O00421 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCRL2O00421 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCRL2O00421 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCRL2O00421 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms