Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QQQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QQQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QQQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QQQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QQQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QQQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QQQ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QQQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QQQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QQQ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QQQ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
J3QQQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QQQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QQQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QQQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QQQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QQQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QQQ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QQQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QQQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QQQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QQQ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QQQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QQQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QQQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QQQ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3QQQ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3QQQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QQQ9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QQQ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QQQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QQQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QQQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QQQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QQQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QQQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QQQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QQQ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QQQ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QQQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QQQ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QQQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QQQ9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QQQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QQQ9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QQQ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QQQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QQQ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QQQ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QQQ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QQQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QQQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QQQ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QQQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QQQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QQQ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QQQ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QQQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QQQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QQQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QQQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QQQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QQQ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QQQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QQQ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3QQQ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3QQQ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3QQQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3QQQ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QQQ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QQQ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QQQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QQQ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QQQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QQQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QQQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QQQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QQQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QQQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QQQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QQQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QQQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QQQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QQQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QQQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QQQ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QQQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QQQ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QQQ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QQQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QQQ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QQQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QQQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QQQ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QQQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QQQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QQQ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QQQ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QQQ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms