Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms