Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BNX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BNX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BNX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BNX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BNX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BNX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BNX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNX3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BNX3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BNX3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNX3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNX3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BNX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BNX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNX3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BNX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNX3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNX3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNX3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNX3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNX3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNX3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNX3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BNX3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
H3BNX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNX3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNX3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNX3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNX3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNX3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNX3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BNX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BNX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNX3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNX3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNX3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNX3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNX3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNX3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNX3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNX3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BNX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BNX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNX3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms