Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VRH5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VRH5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VRH5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VRH5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VRH5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VRH5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8VRH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8VRH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8VRH5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8VRH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8VRH5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F8VRH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
F8VRH5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F8VRH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F8VRH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F8VRH5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F8VRH5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F8VRH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F8VRH5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8VRH5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VRH5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VRH5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VRH5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VRH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VRH5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VRH5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VRH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VRH5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VRH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VRH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VRH5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VRH5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VRH5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VRH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VRH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VRH5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VRH5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VRH5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VRH5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VRH5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VRH5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VRH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VRH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VRH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VRH5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VRH5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VRH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VRH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VRH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VRH5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VRH5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VRH5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VRH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VRH5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VRH5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VRH5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VRH5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VRH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VRH5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VRH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VRH5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VRH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VRH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VRH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VRH5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VRH5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VRH5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VRH5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VRH5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VRH5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VRH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VRH5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VRH5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VRH5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VRH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VRH5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VRH5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VRH5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VRH5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8VRH5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8VRH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8VRH5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
F8VRH5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8VRH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8VRH5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8VRH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8VRH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8VRH5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8VRH5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
F8VRH5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8VRH5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8VRH5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8VRH5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8VRH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8VRH5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8VRH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8VRH5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8VRH5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
F8VRH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms