Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DEV8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DEV8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DEV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DEV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DEV8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DEV8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DEV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DEV8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DEV8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DEV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DEV8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DEV8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DEV8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DEV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DEV8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DEV8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DEV8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DEV8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DEV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DEV8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DEV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DEV8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DEV8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DEV8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DEV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DEV8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DEV8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DEV8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DEV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DEV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DEV8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DEV8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DEV8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DEV8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4DEV8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DEV8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DEV8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DEV8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DEV8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DEV8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DEV8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DEV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DEV8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DEV8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DEV8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DEV8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DEV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DEV8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DEV8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DEV8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DEV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DEV8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DEV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DEV8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DEV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DEV8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DEV8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DEV8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DEV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DEV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DEV8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DEV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DEV8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DEV8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DEV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DEV8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DEV8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DEV8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
B4DEV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
B4DEV8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DEV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DEV8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DEV8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DEV8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DEV8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DEV8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DEV8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DEV8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DEV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DEV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DEV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DEV8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DEV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DEV8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DEV8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DEV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DEV8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DEV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DEV8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DEV8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DEV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DEV8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DEV8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DEV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DEV8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DEV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DEV8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DEV8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DEV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms