Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSPB2A8KAH6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPB2A8KAH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPB2A8KAH6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSPB2A8KAH6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPB2A8KAH6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB2A8KAH6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB2A8KAH6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPB2A8KAH6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPB2A8KAH6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPB2A8KAH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPB2A8KAH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPB2A8KAH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPB2A8KAH6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms