Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP2LA6PVI3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP2LA6PVI3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP2LA6PVI3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP2LA6PVI3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP2LA6PVI3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP2LA6PVI3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms