Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL33A6NCF5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL33A6NCF5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL33A6NCF5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL33A6NCF5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL33A6NCF5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL33A6NCF5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL33A6NCF5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms