Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf49A4QMS7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf49A4QMS7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf49A4QMS7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf49A4QMS7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf49A4QMS7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf49A4QMS7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf49A4QMS7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf49A4QMS7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf49A4QMS7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf49A4QMS7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf49A4QMS7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291 ms