Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNP1A1A4G5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNP1A1A4G5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNP1A1A4G5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNP1A1A4G5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNP1A1A4G5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNP1A1A4G5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LNP1A1A4G5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LNP1A1A4G5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNP1A1A4G5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNP1A1A4G5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNP1A1A4G5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LNP1A1A4G5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNP1A1A4G5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNP1A1A4G5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms