Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms