Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIKINA0A087WXM9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIKINA0A087WXM9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIKINA0A087WXM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIKINA0A087WXM9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIKINA0A087WXM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms