Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
EEA1Q15075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
EEA1Q15075 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms