Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 GDB1YPR184W 4611 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RIM15YFL033C 5313 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 TRM13YOL125W 1431 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 UBX3YDL091C 1368 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 FBP26YJL155C 1359 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 UBC9YDL064W 474 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 MIG3YER028C 1185 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 VMA21YGR105W 234 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 BIG1YHR101C 1008 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 SPL2YHR136C 447 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 SEC13YLR208W 894 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 TSR4YOL022C 1227 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 PSF3YOL146W 585 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YOR366WYOR366W 354 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ECM23YPL021W 564 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 CSM4YPL200W 471 nt5.34□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 CBP1YJL209W 1965 nt5.34□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PUF3Q07807 UBP7YIL156W 3216 nt5.34□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ASM4YDL088C 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 PRR1YKL116C 1557 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 TFA1YKL028W 1449 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MSN4YKL062W 1893 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 AIM7YDR063W 450 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 GRX4YER174C 735 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YAP3YHL009C 993 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 AGE2YIL044C 897 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MRPL44YMR225C 297 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 GPI15YNL038W 690 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 FMP41YNL168C 780 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 GGA1YDR358W 1674 nt5.33□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 PRP31YGR091W 1485 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MAL12YGR292W 1755 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MAL32YBR299W 1755 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 THP1YOL072W 1368 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 AFT1YGL071W 2073 nt5.32□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF3Q07807 TRM8YDL201W 861 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 PHO13YDL236W 939 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 FAU1YER183C 636 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 NIT2YJL126W 924 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ATG27YJL178C 816 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 CKA2YOR061W 1020 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MET3YJR010W 1536 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 IMA1YGR287C 1770 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 LTV1YKL143W 1392 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 FUI1YBL042C 1920 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 HXT14YNL318C 1623 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 GAS3YMR215W 1575 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YDL032WYDL032W 312 nt5.31□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF3Q07807 IES5YER092W 378 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 FUR1YHR128W 651 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 TPM2YIL138C 486 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 EAF6YJR082C 342 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YJR085CYJR085C 318 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YKR011CYKR011C 1062 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 PAU17YLL025W 375 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 HRI1YLR301W 735 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YNL019CYNL019C 855 nt5.31□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF3Q07807 YNL033WYNL033W 855 nt5.31□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF3Q07807 YNR071CYNR071C 1029 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 BUB3YOR026W 1026 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ECM33YBR078W 1290 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 GPX2YBR244W 489 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YJR015WYJR015W 1533 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 SIS2YKR072C 1689 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 RAD30YDR419W 1899 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YIL067CYIL067C 2037 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 NGR1YBR212W 2019 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MGS1YNL218W 1764 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ADE4YMR300C 1533 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 CDC50YCR094W 1176 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 SDC1YDR469W 528 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ASG7YJL170C 630 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ACF4YJR083C 930 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 FUN19YAL034C 1242 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 ATG3YNR007C 933 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 DBF2YGR092W 1719 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 SEC39YLR440C 2130 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YDR391CYDR391C 699 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 TMA20YER007C-A 546 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 HOP2YGL033W 657 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 PIR3YKL163W 978 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 snR3snR3 194 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 GCD10YNL062C 1437 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 CDC40YDR364C 1368 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 RRN3YKL125W 1884 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 MMT2YPL224C 1455 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 AAD4YDL243C 990 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 DBP8YHR169W 1296 nt5.28□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF3Q07807 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 BRX1YOL077C 876 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 EXO1YOR033C 2109 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.5 ms