RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
BRX1YOL077C DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
BRX1YOL077C FAP1P53971 965 aa10.54□□□□□ -0.72
BRX1YOL077C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
BRX1YOL077C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
BRX1YOL077C AVT3P36062 692 aa10.22□□□□□ -0.77
BRX1YOL077C ISW2Q08773 1120 aa10.19□□□□□ -0.78
BRX1YOL077C PRI1P10363 409 aa10.08□□□□□ -0.8
BRX1YOL077C RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
BRX1YOL077C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BRX1YOL077C AAD16Q02895 342 aa9.97□□□□□ -0.81
BRX1YOL077C PRY3P47033 881 aa9.84□□□□□ -0.83
BRX1YOL077C TFA1P36100 482 aa9.62□□□□□ -0.87
BRX1YOL077C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
BRX1YOL077C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
BRX1YOL077C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
BRX1YOL077C REB1P21538 810 aa9.56□□□□□ -0.88
BRX1YOL077C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
BRX1YOL077C MRPL32P25348 183 aa9.24□□□□□ -0.93
BRX1YOL077C SPT21P35209 758 aa9.17□□□□□ -0.94
BRX1YOL077C YCK3P39962 524 aa9.16□□□□□ -0.94
BRX1YOL077C RIM101P33400 625 aa9□□□□□ -0.97
BRX1YOL077C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
BRX1YOL077C CDC27P38042 758 aa8.82□□□□□ -1
BRX1YOL077C HOP09932 586 aa8.8□□□□□ -1
BRX1YOL077C TFC8Q12308 588 aa8.78□□□□□ -1
BRX1YOL077C DCD1P06773 312 aa8.73□□□□□ -1.01
BRX1YOL077C OXP1P28273 1286 aa8.71□□□□□ -1.02
BRX1YOL077C YGL015CP33199 130 aa8.68□□□□□ -1.02
BRX1YOL077C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
BRX1YOL077C PTP3P40048 928 aa8.65□□□□□ -1.02
BRX1YOL077C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
BRX1YOL077C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
BRX1YOL077C SSP1P38871 571 aa8.53□□□□□ -1.04
BRX1YOL077C BCH2P36122 765 aa8.51□□□□□ -1.05
BRX1YOL077C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
BRX1YOL077C RSM7P47150 247 aa8.5□□□□□ -1.05
BRX1YOL077C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.47□□□□□ -1.05not detected
BRX1YOL077C SCY1P53009 804 aa8.46□□□□□ -1.06
BRX1YOL077C YLR271WQ06152 274 aa8.44□□□□□ -1.06
BRX1YOL077C BBC1P47068 1157 aa8.38□□□□□ -1.07
BRX1YOL077C AI2P03876 854 aa8.37□□□□□ -1.07
BRX1YOL077C EPS1P40557 701 aa8.37□□□□□ -1.07
BRX1YOL077C SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
BRX1YOL077C BDF1P35817 686 aa8.3□□□□□ -1.08
BRX1YOL077C MGA2P40578 1113 aa8.26□□□□□ -1.09
BRX1YOL077C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
BRX1YOL077C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
BRX1YOL077C CST9Q06032 482 aa8.18□□□□□ -1.1
BRX1YOL077C TGL3P40308 642 aa8.12□□□□□ -1.11
BRX1YOL077C MRM1P25270 412 aa8.11□□□□□ -1.11
BRX1YOL077C RTG3P38165 486 aa8□□□□□ -1.13
BRX1YOL077C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
BRX1YOL077C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.93□□□□□ -1.14not detected
BRX1YOL077C YAP5P40574 245 aa7.93□□□□□ -1.14
BRX1YOL077C RCR1P38212 213 aa7.91□□□□□ -1.14
BRX1YOL077C YOR238WQ08634 303 aa7.9□□□□□ -1.14
BRX1YOL077C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.88□□□□□ -1.15not detected
BRX1YOL077C VPS29P38759 282 aa7.87□□□□□ -1.15
BRX1YOL077C DMA1P38823 416 aa7.85□□□□□ -1.15
BRX1YOL077C RAM2P29703 316 aa7.83□□□□□ -1.16
BRX1YOL077C PIB1Q06651 286 aa7.83□□□□□ -1.16
BRX1YOL077C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
BRX1YOL077C MST1P07236 462 aa7.81□□□□□ -1.16
BRX1YOL077C YFR006WP43590 535 aa7.8□□□□□ -1.16
BRX1YOL077C GTT3P39996 337 aa7.78□□□□□ -1.16
BRX1YOL077C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
BRX1YOL077C STS1P38637 319 aa7.77□□□□□ -1.17
BRX1YOL077C UBP9P39967 754 aa7.75□□□□□ -1.17
BRX1YOL077C MIF2P35201 549 aa7.69□□□□□ -1.18
BRX1YOL077C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
BRX1YOL077C WSC3Q12215 556 aa7.66□□□□□ -1.18
BRX1YOL077C COQ8P27697 501 aa7.65□□□□□ -1.18
BRX1YOL077C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
BRX1YOL077C SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
BRX1YOL077C YBL029C-AQ3E756 94 aa7.64□□□□□ -1.19
BRX1YOL077C EDS1P38073 919 aa7.59□□□□□ -1.19
BRX1YOL077C YOL036WQ08206 761 aa7.58□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C SAM3Q08986 587 aa7.58□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C VNX1P42839 908 aa7.57□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C SET4P42948 560 aa7.57□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C MSB4Q12317 492 aa7.57□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C SPP1Q03012 353 aa7.55□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C GYP5Q12344 894 aa7.55□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C IFH1P39520 1085 aa7.54□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C ATH1P48016 1211 aa7.54□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
BRX1YOL077C ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C GUT1P32190 709 aa7.49□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C DCW1P36091 449 aa7.49□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C ULI1P43604 169 aa7.48□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C HTA2P04912 132 aa7.47□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
BRX1YOL077C VPS70P47161 811 aa7.46□□□□□ -1.22
BRX1YOL077C YPR148CQ06523 435 aa7.45□□□□□ -1.22
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