Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHKA1P46020 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms