RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270708.11

WRAP73-201, Transcript of WD repeat containing, antisense to TP73, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WRAP73, Length 1,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRAP73-201ENST00000270708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.46■■■■■ 5.51
WRAP73-201ENST00000270708 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.1■■■■■ 4.49
WRAP73-201ENST00000270708 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
WRAP73-201ENST00000270708 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.89■■■■■ 4.14
WRAP73-201ENST00000270708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.72■■■■■ 4.11
WRAP73-201ENST00000270708 ABCC9O60706 1549 aa40.5■■■■■ 4.07
WRAP73-201ENST00000270708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.46■■■■■ 4.07
WRAP73-201ENST00000270708 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.32■■■■■ 4.04
WRAP73-201ENST00000270708 NACADO15069 1562 aa40.04■■■■■ 4
WRAP73-201ENST00000270708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
WRAP73-201ENST00000270708 SCRIBQ14160 1630 aa39.65■■■■□ 3.94
WRAP73-201ENST00000270708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.02■■■■□ 3.84
WRAP73-201ENST00000270708 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
WRAP73-201ENST00000270708 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.49■■■■□ 3.75
WRAP73-201ENST00000270708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
WRAP73-201ENST00000270708 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
WRAP73-201ENST00000270708 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.22■■■■□ 3.71
WRAP73-201ENST00000270708 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.2■■■■□ 3.71
WRAP73-201ENST00000270708 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
WRAP73-201ENST00000270708 SMARCA4P51532 1647 aa38.01■■■■□ 3.68
WRAP73-201ENST00000270708 WIZO95785 1651 aa37.99■■■■□ 3.67
WRAP73-201ENST00000270708 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
WRAP73-201ENST00000270708 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.52■■■■□ 3.6
WRAP73-201ENST00000270708 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.47■■■■□ 3.59
WRAP73-201ENST00000270708 SMARCA2P51531 1590 aa37.29■■■■□ 3.56
WRAP73-201ENST00000270708 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
WRAP73-201ENST00000270708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.28■■■■□ 3.56
WRAP73-201ENST00000270708 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.15■■■■□ 3.54
WRAP73-201ENST00000270708 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
WRAP73-201ENST00000270708 HMGXB3Q12766 1538 aa36.92■■■■□ 3.5
WRAP73-201ENST00000270708 NCAPD3P42695 1498 aa36.91■■■■□ 3.5
WRAP73-201ENST00000270708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.71■■■■□ 3.47
WRAP73-201ENST00000270708 TRIM41Q8WV44 630 aa36.66■■■■□ 3.46
WRAP73-201ENST00000270708 ABCC8Q09428 1581 aa36.47■■■■□ 3.43
WRAP73-201ENST00000270708 PRDM2Q13029 1718 aa36.17■■■■□ 3.38
WRAP73-201ENST00000270708 CFTRP13569 1480 aa36.16■■■■□ 3.38
WRAP73-201ENST00000270708 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
WRAP73-201ENST00000270708 SYNJ1O43426 1573 aa36.06■■■■□ 3.36
WRAP73-201ENST00000270708 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.04■■■■□ 3.36
WRAP73-201ENST00000270708 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
WRAP73-201ENST00000270708 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.97■■■■□ 3.35
WRAP73-201ENST00000270708 TOP2BQ02880 1626 aa35.89■■■■□ 3.34
WRAP73-201ENST00000270708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.89■■■■□ 3.34
WRAP73-201ENST00000270708 SOGA1O94964 1423 aa35.78■■■■□ 3.32
WRAP73-201ENST00000270708 EEA1Q15075 1411 aa35.74■■■■□ 3.31
WRAP73-201ENST00000270708 CUX1P39880 1505 aa35.73■■■■□ 3.31
WRAP73-201ENST00000270708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.68■■■■□ 3.3
WRAP73-201ENST00000270708 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.66■■■■□ 3.3
WRAP73-201ENST00000270708 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.64■■■■□ 3.3
WRAP73-201ENST00000270708 NESP48681 1621 aa35.64■■■■□ 3.3
WRAP73-201ENST00000270708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.6■■■■□ 3.29
WRAP73-201ENST00000270708 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.52■■■■□ 3.28
WRAP73-201ENST00000270708 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.49■■■■□ 3.27
WRAP73-201ENST00000270708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.36■■■■□ 3.25
WRAP73-201ENST00000270708 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.36■■■■□ 3.25
WRAP73-201ENST00000270708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.34■■■■□ 3.25
WRAP73-201ENST00000270708 KIF21BO75037 1637 aa35.33■■■■□ 3.25
WRAP73-201ENST00000270708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.31■■■■□ 3.24
WRAP73-201ENST00000270708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.3■■■■□ 3.24
WRAP73-201ENST00000270708 GOLGA3Q08378 1498 aa35.28■■■■□ 3.24
WRAP73-201ENST00000270708 TOPBP1Q92547 1522 aa35.26■■■■□ 3.23
WRAP73-201ENST00000270708 KIF27Q86VH2 1401 aa35.22■■■■□ 3.23
WRAP73-201ENST00000270708 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.19■■■■□ 3.22
WRAP73-201ENST00000270708 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
WRAP73-201ENST00000270708 CUX2O14529 1486 aa35.09■■■■□ 3.21
WRAP73-201ENST00000270708 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
WRAP73-201ENST00000270708 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
WRAP73-201ENST00000270708 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.04■■■■□ 3.2
WRAP73-201ENST00000270708 PRXQ9BXM0 1461 aa35.04■■■■□ 3.2
WRAP73-201ENST00000270708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.03■■■■□ 3.2
WRAP73-201ENST00000270708 CEP162Q5TB80 1403 aa35.02■■■■□ 3.2
WRAP73-201ENST00000270708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.98■■■■□ 3.19
WRAP73-201ENST00000270708 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.98■■■■□ 3.19
WRAP73-201ENST00000270708 WDR97A6NE52 1622 aa34.95■■■■□ 3.19
WRAP73-201ENST00000270708 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.91■■■■□ 3.18
WRAP73-201ENST00000270708 IGF1RP08069 1367 aa34.88■■■■□ 3.17
WRAP73-201ENST00000270708 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
WRAP73-201ENST00000270708 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.74■■■■□ 3.15
WRAP73-201ENST00000270708 WDR62O43379 1518 aa34.73■■■■□ 3.15
WRAP73-201ENST00000270708 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.71■■■■□ 3.15
WRAP73-201ENST00000270708 CLIP1P30622 1438 aa34.71■■■■□ 3.15
WRAP73-201ENST00000270708 ERCC6Q03468 1493 aa34.69■■■■□ 3.14
WRAP73-201ENST00000270708 CUL7Q14999 1698 aa34.68■■■■□ 3.14
WRAP73-201ENST00000270708 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
WRAP73-201ENST00000270708 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.6■■■■□ 3.13
WRAP73-201ENST00000270708 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
WRAP73-201ENST00000270708 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.59■■■■□ 3.13
WRAP73-201ENST00000270708 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
WRAP73-201ENST00000270708 PBRM1Q86U86 1689 aa34.51■■■■□ 3.12
WRAP73-201ENST00000270708 IFT140Q96RY7 1462 aa34.5■■■■□ 3.11
WRAP73-201ENST00000270708 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
WRAP73-201ENST00000270708 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.43■■■■□ 3.1
WRAP73-201ENST00000270708 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.39■■■■□ 3.1
WRAP73-201ENST00000270708 ARAP1Q96P48 1450 aa34.37■■■■□ 3.09
WRAP73-201ENST00000270708 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
WRAP73-201ENST00000270708 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
WRAP73-201ENST00000270708 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.31■■■■□ 3.08
WRAP73-201ENST00000270708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
WRAP73-201ENST00000270708 GRIN2BQ13224 1484 aa34.29■■■■□ 3.08
WRAP73-201ENST00000270708 ADAMTS12P58397 1594 aa34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms