Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms