Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSO14618 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSO14618 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSO14618 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSO14618 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSO14618 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSO14618 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSO14618 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSO14618 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCSO14618 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCSO14618 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCSO14618 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCSO14618 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCSO14618 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCSO14618 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCSO14618 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCSO14618 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms