RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.35■■■■□ 3.89
SPNS2-201ENST00000329078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.25■■■■□ 3.23
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SPNS2-201ENST00000329078 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
SPNS2-201ENST00000329078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
SPNS2-201ENST00000329078 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.05■■■□□ 2.88
SPNS2-201ENST00000329078 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.81■■■□□ 2.84
SPNS2-201ENST00000329078 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.68■■■□□ 2.82
SPNS2-201ENST00000329078 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.66■■■□□ 2.82
SPNS2-201ENST00000329078 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.65■■■□□ 2.82
SPNS2-201ENST00000329078 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
SPNS2-201ENST00000329078 HRCP23327 699 aa32.57■■■□□ 2.8
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SPNS2-201ENST00000329078 TRIM41Q8WV44 630 aa31.97■■■□□ 2.71
SPNS2-201ENST00000329078 SCRIBQ14160 1630 aa31.79■■■□□ 2.68
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC9O60706 1549 aa31.76■■■□□ 2.67
SPNS2-201ENST00000329078 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.57■■■□□ 2.65
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
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SPNS2-201ENST00000329078 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
SPNS2-201ENST00000329078 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
SPNS2-201ENST00000329078 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.18■■■□□ 2.58
SPNS2-201ENST00000329078 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.14■■■□□ 2.57
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SPNS2-201ENST00000329078 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SPNS2-201ENST00000329078 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.86■■■□□ 2.53
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SPNS2-201ENST00000329078 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
SPNS2-201ENST00000329078 WIZO95785 1651 aa30.66■■■□□ 2.5
SPNS2-201ENST00000329078 NACADO15069 1562 aa30.59■■■□□ 2.49
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC8Q09428 1581 aa30.35■■■□□ 2.45
SPNS2-201ENST00000329078 NEUROD1Q13562 356 aa30.27■■■□□ 2.44
SPNS2-201ENST00000329078 MYT1Q01538 1121 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS2-201ENST00000329078 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
SPNS2-201ENST00000329078 SOGA1O94964 1423 aa30.2■■■□□ 2.43
SPNS2-201ENST00000329078 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.2■■■□□ 2.42
SPNS2-201ENST00000329078 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.19■■■□□ 2.42
SPNS2-201ENST00000329078 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
SPNS2-201ENST00000329078 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SPNS2-201ENST00000329078 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
SPNS2-201ENST00000329078 APLP2Q06481 763 aa30.04■■■□□ 2.4
SPNS2-201ENST00000329078 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.02■■■□□ 2.4
SPNS2-201ENST00000329078 CEP162Q5TB80 1403 aa30.01■■■□□ 2.39
SPNS2-201ENST00000329078 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SPNS2-201ENST00000329078 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
SPNS2-201ENST00000329078 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCA4P51532 1647 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCA2P51531 1590 aa29.77■■■□□ 2.36
SPNS2-201ENST00000329078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
SPNS2-201ENST00000329078 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.71■■■□□ 2.35
SPNS2-201ENST00000329078 ITGAEP38570 1179 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA3Q08378 1498 aa29.55■■■□□ 2.32
SPNS2-201ENST00000329078 CLIP1P30622 1438 aa29.52■■■□□ 2.32
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SPNS2-201ENST00000329078 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
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SPNS2-201ENST00000329078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SPNS2-201ENST00000329078 EEA1Q15075 1411 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS2-201ENST00000329078 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS2-201ENST00000329078 MIER1Q8N108 512 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS2-201ENST00000329078 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS2-201ENST00000329078 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS2-201ENST00000329078 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS2-201ENST00000329078 SYNJ1O43426 1573 aa29.28■■■□□ 2.28
SPNS2-201ENST00000329078 P3H3Q8IVL6 736 aa29.23■■■□□ 2.27
SPNS2-201ENST00000329078 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SPNS2-201ENST00000329078 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS2-201ENST00000329078 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SPNS2-201ENST00000329078 KIF21BO75037 1637 aa28.86■■■□□ 2.21
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SPNS2-201ENST00000329078 KIF27Q86VH2 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
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SPNS2-201ENST00000329078 BCANQ96GW7 911 aa28.74■■■□□ 2.19
SPNS2-201ENST00000329078 ARAP1Q96P48 1450 aa28.7■■■□□ 2.18
SPNS2-201ENST00000329078 CUX2O14529 1486 aa28.69■■■□□ 2.18
SPNS2-201ENST00000329078 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
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SPNS2-201ENST00000329078 TOP2BQ02880 1626 aa28.64■■■□□ 2.18
SPNS2-201ENST00000329078 CUX1P39880 1505 aa28.62■■■□□ 2.17
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SPNS2-201ENST00000329078 IGF1RP08069 1367 aa28.47■■■□□ 2.15
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.45■■■□□ 2.14
SPNS2-201ENST00000329078 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.45■■■□□ 2.14
SPNS2-201ENST00000329078 CFTRP13569 1480 aa28.39■■■□□ 2.13
SPNS2-201ENST00000329078 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS2-201ENST00000329078 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.33■■■□□ 2.13
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