Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDXQ7Z353 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms