RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517910.1

AP003356.1-202, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AP003356.1, Length 2,770 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003356.1-202ENST00000517910 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.27■■■■□ 3.4
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AP003356.1-202ENST00000517910 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.36■■■□□ 2.77
AP003356.1-202ENST00000517910 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.36■■■□□ 2.77
AP003356.1-202ENST00000517910 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
AP003356.1-202ENST00000517910 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
AP003356.1-202ENST00000517910 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.08■■■□□ 2.73
AP003356.1-202ENST00000517910 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.87■■■□□ 2.69
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AP003356.1-202ENST00000517910 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
AP003356.1-202ENST00000517910 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
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AP003356.1-202ENST00000517910 MYT1Q01538 1121 aa30.99■■■□□ 2.55
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AP003356.1-202ENST00000517910 MIER1Q8N108 512 aa29.21■■■□□ 2.27
AP003356.1-202ENST00000517910 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
AP003356.1-202ENST00000517910 BCL11AQ9H165 835 aa28.98■■■□□ 2.23
AP003356.1-202ENST00000517910 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.93■■■□□ 2.22
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AP003356.1-202ENST00000517910 CEP162Q5TB80 1403 aa28.65■■■□□ 2.18
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AP003356.1-202ENST00000517910 ABCC8Q09428 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
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AP003356.1-202ENST00000517910 ITGAEP38570 1179 aa27.82■■■□□ 2.04
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AP003356.1-202ENST00000517910 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.67■■■□□ 2.02
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AP003356.1-202ENST00000517910 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.58■■■□□ 2.01
AP003356.1-202ENST00000517910 TRIM52Q96A61 297 aa27.58■■■□□ 2.01
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AP003356.1-202ENST00000517910 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 SMARCA4P51532 1647 aa27.35■■□□□ 1.97
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AP003356.1-202ENST00000517910 CUX2O14529 1486 aa27.34■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 ANP32CO43423 234 aa27.33■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
AP003356.1-202ENST00000517910 SYNJ1O43426 1573 aa27.29■■□□□ 1.96
AP003356.1-202ENST00000517910 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 WDR97A6NE52 1622 aa27.25■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 MAPKBP1O60336 1514 aa27.25■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.25■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.23■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.19■■□□□ 1.94
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