RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.1■■■■■ 4.01
ILF3-217ENST00000589998 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
ILF3-217ENST00000589998 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
ILF3-217ENST00000589998 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
ILF3-217ENST00000589998 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.93■■■■□ 3.02
ILF3-217ENST00000589998 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.4■■■□□ 2.94
ILF3-217ENST00000589998 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.32■■■□□ 2.92
ILF3-217ENST00000589998 HRCP23327 699 aa33.09■■■□□ 2.89
ILF3-217ENST00000589998 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.06■■■□□ 2.88
ILF3-217ENST00000589998 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.87■■■□□ 2.85
ILF3-217ENST00000589998 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.75■■■□□ 2.83
ILF3-217ENST00000589998 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.36■■■□□ 2.77
ILF3-217ENST00000589998 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ILF3-217ENST00000589998 ABCC9O60706 1549 aa32.23■■■□□ 2.75
ILF3-217ENST00000589998 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
ILF3-217ENST00000589998 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
ILF3-217ENST00000589998 SCRIBQ14160 1630 aa31.89■■■□□ 2.7
ILF3-217ENST00000589998 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.72■■■□□ 2.67
ILF3-217ENST00000589998 TRIM41Q8WV44 630 aa31.65■■■□□ 2.66
ILF3-217ENST00000589998 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
ILF3-217ENST00000589998 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
ILF3-217ENST00000589998 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.26■■■□□ 2.6
ILF3-217ENST00000589998 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.22■■■□□ 2.59
ILF3-217ENST00000589998 NACADO15069 1562 aa31.2■■■□□ 2.59
ILF3-217ENST00000589998 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.18■■■□□ 2.58
ILF3-217ENST00000589998 WIZO95785 1651 aa31.12■■■□□ 2.57
ILF3-217ENST00000589998 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
ILF3-217ENST00000589998 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
ILF3-217ENST00000589998 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
ILF3-217ENST00000589998 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
ILF3-217ENST00000589998 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
ILF3-217ENST00000589998 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ILF3-217ENST00000589998 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
ILF3-217ENST00000589998 ABCC8Q09428 1581 aa30.58■■■□□ 2.49
ILF3-217ENST00000589998 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.52■■■□□ 2.48
ILF3-217ENST00000589998 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.47
ILF3-217ENST00000589998 SMARCA4P51532 1647 aa30.49■■■□□ 2.47
ILF3-217ENST00000589998 SMARCA2P51531 1590 aa30.46■■■□□ 2.47
ILF3-217ENST00000589998 CEP162Q5TB80 1403 aa30.42■■■□□ 2.46
ILF3-217ENST00000589998 SOGA1O94964 1423 aa30.33■■■□□ 2.45
ILF3-217ENST00000589998 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
ILF3-217ENST00000589998 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.32■■■□□ 2.44
ILF3-217ENST00000589998 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
ILF3-217ENST00000589998 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.3■■■□□ 2.44
ILF3-217ENST00000589998 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
ILF3-217ENST00000589998 NEUROD1Q13562 356 aa30.25■■■□□ 2.43
ILF3-217ENST00000589998 EEA1Q15075 1411 aa30.22■■■□□ 2.43
ILF3-217ENST00000589998 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.18■■■□□ 2.42
ILF3-217ENST00000589998 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.15■■■□□ 2.42
ILF3-217ENST00000589998 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA3Q08378 1498 aa30.08■■■□□ 2.41
ILF3-217ENST00000589998 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ILF3-217ENST00000589998 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.99■■■□□ 2.39
ILF3-217ENST00000589998 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
ILF3-217ENST00000589998 KIF21BO75037 1637 aa29.87■■■□□ 2.37
ILF3-217ENST00000589998 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.85■■■□□ 2.37
ILF3-217ENST00000589998 SYNJ1O43426 1573 aa29.85■■■□□ 2.37
ILF3-217ENST00000589998 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.85■■■□□ 2.37
ILF3-217ENST00000589998 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.82■■■□□ 2.36
ILF3-217ENST00000589998 CLIP1P30622 1438 aa29.74■■■□□ 2.35
ILF3-217ENST00000589998 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ILF3-217ENST00000589998 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.354e-8■■□□□ 11.9
ILF3-217ENST00000589998 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.68■■■□□ 2.34
ILF3-217ENST00000589998 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
ILF3-217ENST00000589998 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ILF3-217ENST00000589998 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.59■■■□□ 2.33
ILF3-217ENST00000589998 MIER1Q8N108 512 aa29.56■■■□□ 2.32
ILF3-217ENST00000589998 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.54■■■□□ 2.32
ILF3-217ENST00000589998 APLP2Q06481 763 aa29.5■■■□□ 2.31
ILF3-217ENST00000589998 TOP2BQ02880 1626 aa29.42■■■□□ 2.3
ILF3-217ENST00000589998 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
ILF3-217ENST00000589998 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.34■■■□□ 2.29
ILF3-217ENST00000589998 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.29■■■□□ 2.28
ILF3-217ENST00000589998 ARAP1Q96P48 1450 aa29.24■■■□□ 2.27
ILF3-217ENST00000589998 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.23■■■□□ 2.27
ILF3-217ENST00000589998 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
ILF3-217ENST00000589998 PRXQ9BXM0 1461 aa29.22■■■□□ 2.27
ILF3-217ENST00000589998 MYT1Q01538 1121 aa29.19■■■□□ 2.26
ILF3-217ENST00000589998 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ILF3-217ENST00000589998 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
ILF3-217ENST00000589998 CUX1P39880 1505 aa29.04■■■□□ 2.24
ILF3-217ENST00000589998 CUX2O14529 1486 aa28.97■■■□□ 2.23
ILF3-217ENST00000589998 KIF27Q86VH2 1401 aa28.97■■■□□ 2.23
ILF3-217ENST00000589998 HMGXB3Q12766 1538 aa28.93■■■□□ 2.22
ILF3-217ENST00000589998 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.91■■■□□ 2.22
ILF3-217ENST00000589998 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.89■■■□□ 2.22
ILF3-217ENST00000589998 NCAPD3P42695 1498 aa28.85■■■□□ 2.21
ILF3-217ENST00000589998 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
ILF3-217ENST00000589998 CFTRP13569 1480 aa28.78■■■□□ 2.2
ILF3-217ENST00000589998 ITGAEP38570 1179 aa28.74■■■□□ 2.19
ILF3-217ENST00000589998 MAPKBP1O60336 1514 aa28.71■■■□□ 2.19
ILF3-217ENST00000589998 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.71■■■□□ 2.19
ILF3-217ENST00000589998 TIAM1Q13009 1591 aa28.7■■■□□ 2.19
ILF3-217ENST00000589998 PRDM2Q13029 1718 aa28.7■■■□□ 2.19
ILF3-217ENST00000589998 MAP3K1Q13233 1512 aa28.65■■■□□ 2.18
ILF3-217ENST00000589998 IGF1RP08069 1367 aa28.6■■■□□ 2.17
ILF3-217ENST00000589998 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.56■■■□□ 2.16
ILF3-217ENST00000589998 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.56■■■□□ 2.16
ILF3-217ENST00000589998 KCNH8Q96L42 1107 aa28.54■■■□□ 2.16
ILF3-217ENST00000589998 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms