RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560650.1

CPEB1-AS1-201, CPEB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1-AS1, Length 2,138 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.37■■■■■ 5.01
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.26■■■■□ 3.72
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.61■■■■□ 3.61
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SCRIBQ14160 1630 aa37.08■■■■□ 3.53
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.06■■■■□ 3.36
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.88■■■■□ 3.34
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.78■■■■□ 3.32
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.76■■■■□ 3.32
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.02■■■■□ 3.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.92■■■■□ 3.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SMARCA2P51531 1590 aa34.91■■■■□ 3.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TRIM41Q8WV44 630 aa34.86■■■■□ 3.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.85■■■■□ 3.17
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.5■■■■□ 3.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NCAPD3P42695 1498 aa34.44■■■■□ 3.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HMGXB3Q12766 1538 aa34.39■■■■□ 3.1
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.04
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.04■■■■□ 3.04
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.86■■■■□ 3.01
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SOGA1O94964 1423 aa33.85■■■■□ 3.01
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CFTRP13569 1480 aa33.84■■■■□ 3.01
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 EEA1Q15075 1411 aa33.78■■■■□ 3
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.7■■■□□ 2.98
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TOP2BQ02880 1626 aa33.67■■■□□ 2.98
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.66■■■□□ 2.98
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.64■■■□□ 2.98
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.6■■■□□ 2.97
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CUX1P39880 1505 aa33.5■■■□□ 2.95
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NESP48681 1621 aa33.22■■■□□ 2.91
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.16■■■□□ 2.9
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.12■■■□□ 2.89
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.07■■■□□ 2.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PRXQ9BXM0 1461 aa33.04■■■□□ 2.88
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.99■■■□□ 2.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CUX2O14529 1486 aa32.98■■■□□ 2.87
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.95■■■□□ 2.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CLIP1P30622 1438 aa32.89■■■□□ 2.86
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.78■■■□□ 2.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.76■■■□□ 2.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.76■■■□□ 2.83
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.69■■■□□ 2.82
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WDR97A6NE52 1622 aa32.55■■■□□ 2.8
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.4■■■□□ 2.78
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WDR62O43379 1518 aa32.26■■■□□ 2.75
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ERCC6Q03468 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.16■■■□□ 2.74
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PBRM1Q86U86 1689 aa32.11■■■□□ 2.73
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