Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1CQ15572 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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