Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE3Q8IX30 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms