Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-8■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 GIGYF1-203ENST00000471340 478 ntTSL 510.35□□□□□ -0.753e-8■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARHGEF40-204ENST00000555038 1796 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 213.22□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 512.68□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 210.31□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARHGEF40-205ENST00000555052 935 ntTSL 39.73□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARHGEF40-206ENST00000555232 3902 ntTSL 29.49□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 TM9SF3-202ENST00000443638 868 ntTSL 34.7□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-7■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CHTOP-206ENST00000495554 2553 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.457e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 29.9□□□□□ -0.837e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.887e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 EPS8L2-210ENST00000527807 814 ntTSL 513.73□□□□□ -0.213e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 EPS8L2-224ENST00000533500 587 ntTSL 313.14□□□□□ -0.313e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.356e-6■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 EPS8L2-229ENST00000534755 474 ntTSL 412.83□□□□□ -0.363e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 311.79□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 EPS8L2-219ENST00000531348 582 ntTSL 210.95□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.746e-6■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 EPS8L2-216ENST00000530118 561 ntTSL 310.35□□□□□ -0.753e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC9.4□□□□□ -0.96e-6■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.665e-8■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.775e-8■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.015e-8■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 ACIN1-214ENST00000555352 579 ntTSL 45.85□□□□□ -1.474e-19■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CYP2W1-205ENST00000468456 557 ntTSL 410.93□□□□□ -0.665e-8■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CYP2W1-204ENST00000462453 566 ntTSL 410.35□□□□□ -0.755e-8■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 311.85□□□□□ -0.512e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PLXNB1-211ENST00000470525 835 ntTSL 510.57□□□□□ -0.723e-6■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PLXNB1-214ENST00000478171 576 ntTSL 310□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-205ENST00000372819 2100 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.062e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-210ENST00000474208 308 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-215ENST00000489068 442 ntTSL 37.3□□□□□ -1.242e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-208ENST00000372826 854 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-209ENST00000465761 801 ntTSL 26.96□□□□□ -1.32e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-212ENST00000479873 1178 ntTSL 25.46□□□□□ -1.542e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 PABPC1L-206ENST00000372822 536 ntTSL 54.21□□□□□ -1.742e-9■□□□□ 8.6
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-205ENST00000577802 415 ntTSL 28.71□□□□□ -1.024e-12■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-223ENST00000582114 647 ntTSL 27.19□□□□□ -1.264e-12■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-229ENST00000583697 852 ntTSL 35.37□□□□□ -1.554e-12■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.985e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.484e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.314e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MYO18A-224ENST00000636100 1564 ntTSL 516.98■□□□□ 0.314e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SDR39U1-221ENST00000556707 1196 ntTSL 215.1■□□□□ 0.014e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.283e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.314e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SDR39U1-204ENST00000553343 681 ntTSL 212.8□□□□□ -0.364e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 212.29□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SDR39U1-210ENST00000555225 769 ntTSL 311.59□□□□□ -0.554e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.563e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SDR39U1-219ENST00000556523 735 ntTSL 310.91□□□□□ -0.664e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 210.9□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 NOP9-203ENST00000557362 455 ntTSL 510.62□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SDR39U1-217ENST00000556249 556 ntTSL 39.94□□□□□ -0.824e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-6■□□□□ 8.5
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