Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4BP1O75113 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms