Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSL6Q9UKU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.7 ms