Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCOLN3Q8TDD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCOLN3Q8TDD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCOLN3Q8TDD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCOLN3Q8TDD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms