Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP13Q86W25 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP13Q86W25 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms