Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR2Q2VWA4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms