Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PHGDH-224ENST00000641711 712 nt9.16□□□□□ -0.943e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-222ENST00000641587 566 nt9.05□□□□□ -0.963e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-212ENST00000641247 710 nt8.78□□□□□ -13e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-215ENST00000641371 725 nt8.64□□□□□ -1.033e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-228ENST00000641847 692 nt8.32□□□□□ -1.083e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-219ENST00000641513 735 nt7.81□□□□□ -1.163e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-206ENST00000493622 742 ntTSL 57.77□□□□□ -1.173e-16■■■■■ 41.5
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SF3B4Q15427 HSP90B1-206ENST00000550479 698 ntTSL 24.49□□□□□ -1.699e-25■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 412.66□□□□□ -0.385e-12■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FLNC-203ENST00000388853 570 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 41.5
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SF3B4Q15427 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FUNDC2-205ENST00000484175 666 ntTSL 320.32■□□□□ 0.844e-8■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FUNDC2-206ENST00000485289 726 ntTSL 58.4□□□□□ -1.064e-8■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FUNDC2-202ENST00000456179 871 ntTSL 38.11□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FUNDC2-207ENST00000492303 3685 ntTSL 27.58□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 FUNDC2-203ENST00000471528 765 ntTSL 35.94□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 41.5
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SF3B4Q15427 DPM1-202ENST00000371584 1073 ntTSL 510.82□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 41.5
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SF3B4Q15427 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 41.5
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SF3B4Q15427 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 41.2
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SF3B4Q15427 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 41.2
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SF3B4Q15427 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 13e-9■■■■■ 41.1
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SF3B4Q15427 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RAB35-204ENST00000540803 551 ntTSL 217.37■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.322e-17■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-212ENST00000549610 1116 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-204ENST00000546763 846 ntTSL 216.58■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-17■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-17■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-17■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-17■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.015e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.185e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 XRCC1-209ENST00000599693 628 ntTSL 313.71□□□□□ -0.215e-9■■■■■ 41.1
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