Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms