Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms