Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CYTH4Q9UIA0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CYTH4Q9UIA0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CYTH4Q9UIA0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CYTH4Q9UIA0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CYTH4Q9UIA0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CYTH4Q9UIA0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CYTH4Q9UIA0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CYTH4Q9UIA0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CYTH4Q9UIA0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CYTH4Q9UIA0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CYTH4Q9UIA0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CYTH4Q9UIA0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CYTH4Q9UIA0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CYTH4Q9UIA0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CYTH4Q9UIA0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CYTH4Q9UIA0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYTH4Q9UIA0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CYTH4Q9UIA0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CYTH4Q9UIA0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CYTH4Q9UIA0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CYTH4Q9UIA0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CYTH4Q9UIA0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CYTH4Q9UIA0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CYTH4Q9UIA0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CYTH4Q9UIA0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CYTH4Q9UIA0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CYTH4Q9UIA0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CYTH4Q9UIA0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CYTH4Q9UIA0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CYTH4Q9UIA0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CYTH4Q9UIA0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CYTH4Q9UIA0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CYTH4Q9UIA0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CYTH4Q9UIA0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CYTH4Q9UIA0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CYTH4Q9UIA0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CYTH4Q9UIA0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CYTH4Q9UIA0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CYTH4Q9UIA0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CYTH4Q9UIA0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CYTH4Q9UIA0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CYTH4Q9UIA0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CYTH4Q9UIA0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CYTH4Q9UIA0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CYTH4Q9UIA0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CYTH4Q9UIA0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CYTH4Q9UIA0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CYTH4Q9UIA0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CYTH4Q9UIA0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CYTH4Q9UIA0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CYTH4Q9UIA0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CYTH4Q9UIA0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CYTH4Q9UIA0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CYTH4Q9UIA0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CYTH4Q9UIA0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CYTH4Q9UIA0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CYTH4Q9UIA0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CYTH4Q9UIA0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CYTH4Q9UIA0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CYTH4Q9UIA0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CYTH4Q9UIA0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CYTH4Q9UIA0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CYTH4Q9UIA0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CYTH4Q9UIA0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CYTH4Q9UIA0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CYTH4Q9UIA0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CYTH4Q9UIA0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CYTH4Q9UIA0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CYTH4Q9UIA0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CYTH4Q9UIA0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CYTH4Q9UIA0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CYTH4Q9UIA0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CYTH4Q9UIA0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CYTH4Q9UIA0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CYTH4Q9UIA0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CYTH4Q9UIA0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CYTH4Q9UIA0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CYTH4Q9UIA0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CYTH4Q9UIA0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CYTH4Q9UIA0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CYTH4Q9UIA0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CYTH4Q9UIA0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CYTH4Q9UIA0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CYTH4Q9UIA0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CYTH4Q9UIA0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CYTH4Q9UIA0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CYTH4Q9UIA0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CYTH4Q9UIA0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CYTH4Q9UIA0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CYTH4Q9UIA0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CYTH4Q9UIA0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CYTH4Q9UIA0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CYTH4Q9UIA0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms