Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD1Q9NS62 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THSD1Q9NS62 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms