Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.641e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 34.46□□□□□ -1.71e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 32.83□□□□□ -1.961e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 22.82□□□□□ -1.961e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-210ENST00000458280 553 ntTSL 413.6□□□□□ -0.231e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-208ENST00000412911 560 ntTSL 410.63□□□□□ -0.711e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-217ENST00000490700 661 ntTSL 39.99□□□□□ -0.811e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-201ENST00000312283 785 ntTSL 39.66□□□□□ -0.861e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-215ENST00000476384 936 ntTSL 59.37□□□□□ -0.911e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-216ENST00000483434 874 ntTSL 38.76□□□□□ -1.011e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.091e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-211ENST00000460655 572 ntTSL 48.18□□□□□ -1.11e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 STX16-220ENST00000496117 528 ntTSL 57.14□□□□□ -1.271e-27■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-272ENST00000641991 1360 nt7.68□□□□□ -1.181e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-230ENST00000641421 1530 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-247ENST00000641642 1107 nt6.58□□□□□ -1.361e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC6.49□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-263ENST00000641880 1404 nt6.42□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-254ENST00000641719 1443 nt6.35□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC6.15□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-235ENST00000641496 1154 nt5.93□□□□□ -1.461e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-283ENST00000642134 870 nt5.77□□□□□ -1.491e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.521e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.44□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-273ENST00000642010 925 nt5.38□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.37□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-252ENST00000641704 1313 nt5.35□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-207ENST00000641029 1047 nt5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-220ENST00000641298 974 nt5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-224ENST00000641362 1146 nt5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-276ENST00000642077 993 nt5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-239ENST00000641547 915 nt5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-216ENST00000641179 1140 nt5.32□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-240ENST00000641578 1061 nt5.31□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-282ENST00000642126 1206 nt5.25□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-250ENST00000641696 886 nt5.25□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-214ENST00000641171 1493 nt5.19□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC5.13□□□□□ -1.591e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-211ENST00000641106 1184 nt5.04□□□□□ -1.61e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-257ENST00000641786 816 nt4.98□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-213ENST00000641162 1091 nt4.95□□□□□ -1.621e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC4.84□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-269ENST00000641964 1415 nt4.79□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-249ENST00000641681 871 nt4.77□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-277ENST00000642082 1545 nt4.71□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-266ENST00000641934 1050 nt4.7□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-233ENST00000641487 966 nt4.69□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-225ENST00000641365 2219 nt4.66□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-251ENST00000641701 2204 nt4.63□□□□□ -1.671e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-245ENST00000641615 770 nt4.6□□□□□ -1.671e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.56□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC4.55□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.54□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-218ENST00000641218 1522 nt4.43□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-267ENST00000641944 1117 nt4.42□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-253ENST00000641706 818 nt4.42□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.35□□□□□ -1.711e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC4.27□□□□□ -1.731e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-244ENST00000641604 1251 nt4.2□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC4.08□□□□□ -1.761e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.03□□□□□ -1.761e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 33.99□□□□□ -1.771e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-256ENST00000641746 958 nt3.88□□□□□ -1.791e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC3.87□□□□□ -1.791e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC3.87□□□□□ -1.791e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-234ENST00000641488 1157 nt3.8□□□□□ -1.81e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-237ENST00000641514 1074 nt3.8□□□□□ -1.81e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC3.68□□□□□ -1.821e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-215ENST00000641174 959 nt3.5□□□□□ -1.851e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-262ENST00000641867 866 nt3.46□□□□□ -1.861e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC3.4□□□□□ -1.871e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-209ENST00000641060 679 nt3.1□□□□□ -1.911e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-231ENST00000641425 1156 nt2.82□□□□□ -1.961e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-217ENST00000641187 875 nt2.42□□□□□ -2.021e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.051e-6■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.085e-9■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.35e-9■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 FMO5-209ENST00000619062 1842 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 FMO5-206ENST00000533174 671 ntTSL 44.48□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 215.99■□□□□ 0.152e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-202ENST00000323594 739 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-217ENST00000511716 562 ntTSL 36.07□□□□□ -1.442e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 9.4
SRSF9Q13242 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.079e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.129e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.379e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.459e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 AUP1-207ENST00000472800 663 ntTSL 412.08□□□□□ -0.489e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.579e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.729e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-7■□□□□ 9.3
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