RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463900.5

AUP1-204, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AUP1, Length 1,645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-204ENST00000463900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.76■■■■■ 4.28
AUP1-204ENST00000463900 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.01■■■■□ 3.51
AUP1-204ENST00000463900 ABCC9O60706 1549 aa35.94■■■■□ 3.34
AUP1-204ENST00000463900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
AUP1-204ENST00000463900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.84■■■■□ 3.17
AUP1-204ENST00000463900 NACADO15069 1562 aa34.75■■■■□ 3.15
AUP1-204ENST00000463900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.72■■■■□ 3.15
AUP1-204ENST00000463900 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.64■■■■□ 3.14
AUP1-204ENST00000463900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.58■■■■□ 3.13
AUP1-204ENST00000463900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.86■■■■□ 3.01
AUP1-204ENST00000463900 SCRIBQ14160 1630 aa33.77■■■■□ 3
AUP1-204ENST00000463900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.64■■■□□ 2.983e-7■■□□□ 14.3
AUP1-204ENST00000463900 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.61■■■□□ 2.97
AUP1-204ENST00000463900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.35■■■□□ 2.93
AUP1-204ENST00000463900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
AUP1-204ENST00000463900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.7■■■□□ 2.83
AUP1-204ENST00000463900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.52■■■□□ 2.8
AUP1-204ENST00000463900 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.47■■■□□ 2.79
AUP1-204ENST00000463900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
AUP1-204ENST00000463900 SMARCA4P51532 1647 aa32.34■■■□□ 2.77
AUP1-204ENST00000463900 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.17■■■□□ 2.74
AUP1-204ENST00000463900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.11■■■□□ 2.73
AUP1-204ENST00000463900 SMARCA2P51531 1590 aa32.1■■■□□ 2.73
AUP1-204ENST00000463900 NCAPD3P42695 1498 aa32.06■■■□□ 2.72
AUP1-204ENST00000463900 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.03■■■□□ 2.72
AUP1-204ENST00000463900 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
AUP1-204ENST00000463900 HMGXB3Q12766 1538 aa31.91■■■□□ 2.7
AUP1-204ENST00000463900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
AUP1-204ENST00000463900 WIZO95785 1651 aa31.83■■■□□ 2.69
AUP1-204ENST00000463900 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
AUP1-204ENST00000463900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
AUP1-204ENST00000463900 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.17■■■□□ 2.58
AUP1-204ENST00000463900 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.16■■■□□ 2.58
AUP1-204ENST00000463900 NESP48681 1621 aa31.16■■■□□ 2.58
AUP1-204ENST00000463900 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.15■■■□□ 2.58
AUP1-204ENST00000463900 CFTRP13569 1480 aa31.01■■■□□ 2.55
AUP1-204ENST00000463900 ERCC6Q03468 1493 aa31■■■□□ 2.55
AUP1-204ENST00000463900 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
AUP1-204ENST00000463900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.79■■■□□ 2.52
AUP1-204ENST00000463900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.78■■■□□ 2.52
AUP1-204ENST00000463900 PRDM2Q13029 1718 aa30.77■■■□□ 2.52
AUP1-204ENST00000463900 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.72■■■□□ 2.51
AUP1-204ENST00000463900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
AUP1-204ENST00000463900 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.62■■■□□ 2.49
AUP1-204ENST00000463900 CUX2O14529 1486 aa30.56■■■□□ 2.48
AUP1-204ENST00000463900 WDR62O43379 1518 aa30.49■■■□□ 2.47
AUP1-204ENST00000463900 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
AUP1-204ENST00000463900 ABCC8Q09428 1581 aa30.38■■■□□ 2.45
AUP1-204ENST00000463900 TOPBP1Q92547 1522 aa30.31■■■□□ 2.44
AUP1-204ENST00000463900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.3■■■□□ 2.44
AUP1-204ENST00000463900 CUX1P39880 1505 aa30.17■■■□□ 2.42
AUP1-204ENST00000463900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
AUP1-204ENST00000463900 IFT140Q96RY7 1462 aa30.07■■■□□ 2.4
AUP1-204ENST00000463900 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
AUP1-204ENST00000463900 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.04■■■□□ 2.4
AUP1-204ENST00000463900 TOP2BQ02880 1626 aa29.99■■■□□ 2.39
AUP1-204ENST00000463900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.98■■■□□ 2.39
AUP1-204ENST00000463900 SOGA1O94964 1423 aa29.98■■■□□ 2.39
AUP1-204ENST00000463900 SYNJ1O43426 1573 aa29.97■■■□□ 2.39
AUP1-204ENST00000463900 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
AUP1-204ENST00000463900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.93■■■□□ 2.38
AUP1-204ENST00000463900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
AUP1-204ENST00000463900 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
AUP1-204ENST00000463900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.77■■■□□ 2.36
AUP1-204ENST00000463900 WDR97A6NE52 1622 aa29.77■■■□□ 2.36
AUP1-204ENST00000463900 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
AUP1-204ENST00000463900 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.353e-11■■■■■ 56
AUP1-204ENST00000463900 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.64■■■□□ 2.34
AUP1-204ENST00000463900 TRIM41Q8WV44 630 aa29.63■■■□□ 2.33
AUP1-204ENST00000463900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.6■■■□□ 2.33
AUP1-204ENST00000463900 GRIN2BQ13224 1484 aa29.6■■■□□ 2.33
AUP1-204ENST00000463900 PBRM1Q86U86 1689 aa29.52■■■□□ 2.32
AUP1-204ENST00000463900 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.5■■■□□ 2.31
AUP1-204ENST00000463900 KIF27Q86VH2 1401 aa29.49■■■□□ 2.31
AUP1-204ENST00000463900 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
AUP1-204ENST00000463900 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.47■■■□□ 2.31
AUP1-204ENST00000463900 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.43■■■□□ 2.3
AUP1-204ENST00000463900 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.42■■■□□ 2.3
AUP1-204ENST00000463900 FBLN2P98095 1184 aa29.39■■■□□ 2.3
AUP1-204ENST00000463900 OSCARQ8IYS5 282 aa29.38■■■□□ 2.29
AUP1-204ENST00000463900 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
AUP1-204ENST00000463900 SYNJ2O15056 1496 aa29.36■■■□□ 2.29
AUP1-204ENST00000463900 CHD1O14646 1710 aa29.33■■■□□ 2.29
AUP1-204ENST00000463900 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.31■■■□□ 2.28
AUP1-204ENST00000463900 ADAMTS12P58397 1594 aa29.31■■■□□ 2.28
AUP1-204ENST00000463900 IGF1RP08069 1367 aa29.31■■■□□ 2.28
AUP1-204ENST00000463900 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.23■■■□□ 2.27
AUP1-204ENST00000463900 CUL7Q14999 1698 aa29.21■■■□□ 2.27
AUP1-204ENST00000463900 GRIN2AQ12879 1464 aa29.2■■■□□ 2.26
AUP1-204ENST00000463900 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.15■■■□□ 2.26
AUP1-204ENST00000463900 EEA1Q15075 1411 aa29.12■■■□□ 2.25
AUP1-204ENST00000463900 NUP160Q12769 1436 aa29.06■■■□□ 2.24
AUP1-204ENST00000463900 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.03■■■□□ 2.24
AUP1-204ENST00000463900 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.03■■■□□ 2.24
AUP1-204ENST00000463900 CEP170Q5SW79 1584 aa29.01■■■□□ 2.23
AUP1-204ENST00000463900 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.01■■■□□ 2.23
AUP1-204ENST00000463900 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
AUP1-204ENST00000463900 PRXQ9BXM0 1461 aa28.95■■■□□ 2.23
AUP1-204ENST00000463900 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.86■■■□□ 2.21
AUP1-204ENST00000463900 ARHGEF11O15085 1522 aa28.84■■■□□ 2.21
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