RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474052.5

PHYKPL-204, Transcript of 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHYKPL, Length 1,539 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYKPL-204ENST00000474052 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.98■■■■■ 6.71
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PHYKPL-204ENST00000474052 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.09■■■■■ 5.13
PHYKPL-204ENST00000474052 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.09■■■■■ 5.13
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PHYKPL-204ENST00000474052 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
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PHYKPL-204ENST00000474052 NCAPD3P42695 1498 aa44.15■■■■■ 4.66
PHYKPL-204ENST00000474052 SMARCA2P51531 1590 aa44.07■■■■■ 4.65
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PHYKPL-204ENST00000474052 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.88■■■■■ 4.62
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PHYKPL-204ENST00000474052 NESP48681 1621 aa43.33■■■■■ 4.53
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PHYKPL-204ENST00000474052 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.1■■■■■ 4.49
PHYKPL-204ENST00000474052 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
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PHYKPL-204ENST00000474052 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.86■■■■■ 4.45
PHYKPL-204ENST00000474052 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.84■■■■■ 4.45
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PHYKPL-204ENST00000474052 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.42■■■■■ 4.38
PHYKPL-204ENST00000474052 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.41■■■■■ 4.38
PHYKPL-204ENST00000474052 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.4■■■■■ 4.38
PHYKPL-204ENST00000474052 WDR62O43379 1518 aa42.32■■■■■ 4.36
PHYKPL-204ENST00000474052 PRDM2Q13029 1718 aa42.29■■■■■ 4.36
PHYKPL-204ENST00000474052 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
PHYKPL-204ENST00000474052 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.01■■■■■ 4.32
PHYKPL-204ENST00000474052 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
PHYKPL-204ENST00000474052 TOPBP1Q92547 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
PHYKPL-204ENST00000474052 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.62■■■■■ 4.25
PHYKPL-204ENST00000474052 ABCC8Q09428 1581 aa41.57■■■■■ 4.25
PHYKPL-204ENST00000474052 IFT140Q96RY7 1462 aa41.49■■■■■ 4.23
PHYKPL-204ENST00000474052 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
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PHYKPL-204ENST00000474052 CUX1P39880 1505 aa41.26■■■■■ 4.2
PHYKPL-204ENST00000474052 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.17■■■■■ 4.18
PHYKPL-204ENST00000474052 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.16■■■■■ 4.18
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PHYKPL-204ENST00000474052 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
PHYKPL-204ENST00000474052 WDR97A6NE52 1622 aa40.91■■■■■ 4.14
PHYKPL-204ENST00000474052 CHD1O14646 1710 aa40.85■■■■■ 4.13
PHYKPL-204ENST00000474052 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.81■■■■■ 4.12
PHYKPL-204ENST00000474052 SYNJ1O43426 1573 aa40.81■■■■■ 4.12
PHYKPL-204ENST00000474052 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.79■■■■■ 4.12
PHYKPL-204ENST00000474052 TOP2BQ02880 1626 aa40.79■■■■■ 4.12
PHYKPL-204ENST00000474052 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.73■■■■■ 4.11
PHYKPL-204ENST00000474052 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.72■■■■■ 4.11
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PHYKPL-204ENST00000474052 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.66■■■■■ 4.1
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PHYKPL-204ENST00000474052 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
PHYKPL-204ENST00000474052 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
PHYKPL-204ENST00000474052 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
PHYKPL-204ENST00000474052 SYNJ2O15056 1496 aa40.47■■■■■ 4.07
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PHYKPL-204ENST00000474052 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
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PHYKPL-204ENST00000474052 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.22■■■■■ 4.03
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PHYKPL-204ENST00000474052 CEP170Q5SW79 1584 aa40.05■■■■■ 4
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PHYKPL-204ENST00000474052 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.8■■■■□ 3.96
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PHYKPL-204ENST00000474052 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.58■■■■□ 3.93
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