Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW11Q9UKB1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW11Q9UKB1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW11Q9UKB1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms