Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD8Q96LT4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms