Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SLC39A7-203ENST00000444757 1015 ntTSL 512.35□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ABCC3-207ENST00000505699 5271 ntTSL 212.27□□□□□ -0.459e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-212ENST00000539419 563 ntTSL 412.22□□□□□ -0.459e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.469e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.469e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.499e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-210ENST00000530563 721 ntTSL 311.89□□□□□ -0.519e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.539e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-205ENST00000393688 3217 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.599e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.69e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 STARD13-206ENST00000487412 939 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.619e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CTDSPL-207ENST00000447745 793 ntTSL 311.21□□□□□ -0.619e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-209ENST00000515834 7015 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-204ENST00000369840 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.84□□□□□ -0.679e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 510.78□□□□□ -0.689e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.759e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 210.15□□□□□ -0.789e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 STARD13-208ENST00000498019 568 ntTSL 310.05□□□□□ -0.89e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CTDSPL-205ENST00000436654 804 ntTSL 39.87□□□□□ -0.839e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SEC24C-206ENST00000634508 549 ntTSL 49.56□□□□□ -0.887e-14■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-12■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.999e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-218ENST00000474628 743 ntTSL 28.52□□□□□ -1.059e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SEC24C-207ENST00000635550 3424 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SLC44A5-203ENST00000469525 721 ntTSL 57.4□□□□□ -1.229e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PGD-210ENST00000498356 790 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)7.08□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.281e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.511e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-221ENST00000506807 463 ntTSL 34.84□□□□□ -1.639e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.669e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.669e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.79e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.839e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 53.56□□□□□ -1.849e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-216ENST00000565803 3625 ntTSL 53.39□□□□□ -1.879e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.929e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.939e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.979e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 NPRL3-202ENST00000419636 616 ntTSL 517.83■□□□□ 0.441e-17■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PRKACA-202ENST00000350356 3105 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RAD23A-206ENST00000590881 999 ntTSL 515.14■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 PHF1-211ENST00000495509 1752 ntTSL 217.07■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 HDAC7-218ENST00000463732 559 ntTSL 417.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-22■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.295e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 212.57□□□□□ -0.45e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.675e-10■■■■■ 29.6
PCBP1Q15365 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.147e-8■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 GNB2-213ENST00000480159 899 ntTSL 513.8□□□□□ -0.25e-13■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-19■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 ATP5D-206ENST00000591249 405 ntTSL 518.39■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 STT3B-202ENST00000423527 1664 ntTSL 228.13■■■□□ 2.095e-9■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 STT3B-204ENST00000453168 1888 ntTSL 1 (best)27.58■■■□□ 2.015e-9■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.115e-9■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 29.5
PCBP1Q15365 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.44e-18■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 KCTD2-205ENST00000579242 524 ntTSL 414.03□□□□□ -0.163e-14■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 KCTD2-209ENST00000584767 815 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.243e-14■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 KCTD2-207ENST00000582840 565 ntTSL 411.37□□□□□ -0.593e-14■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 KCTD2-208ENST00000584570 666 ntTSL 39.55□□□□□ -0.883e-14■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.023e-14■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.462e-7■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.015e-14■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 PRSS21-208ENST00000575199 679 ntTSL 223.73■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 29.4
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