RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423527.5

STT3B-202, Transcript of STT3B, catalytic subunit of the oligosaccharyltransferase complex, humanhuman

TSL 2

Gene STT3B, Length 1,664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STT3B-202ENST00000423527 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.14■■■■■ 7.22
STT3B-202ENST00000423527 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.93■■■■■ 6.06
STT3B-202ENST00000423527 ABCC9O60706 1549 aa50.89■■■■■ 5.74
STT3B-202ENST00000423527 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.34■■■■■ 5.65
STT3B-202ENST00000423527 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.87■■■■■ 5.57
STT3B-202ENST00000423527 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.73■■■■■ 5.55
STT3B-202ENST00000423527 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.5■■■■■ 5.51
STT3B-202ENST00000423527 NACADO15069 1562 aa49.5■■■■■ 5.51
STT3B-202ENST00000423527 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.3■■■■■ 5.48
STT3B-202ENST00000423527 SCRIBQ14160 1630 aa48.53■■■■■ 5.36
STT3B-202ENST00000423527 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.45■■■■■ 5.35
STT3B-202ENST00000423527 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.35■■■■■ 5.33
STT3B-202ENST00000423527 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.89■■■■■ 5.26
STT3B-202ENST00000423527 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.77■■■■■ 5.24
STT3B-202ENST00000423527 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.82■■■■■ 5.08
STT3B-202ENST00000423527 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
STT3B-202ENST00000423527 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
STT3B-202ENST00000423527 SMARCA4P51532 1647 aa46.45■■■■■ 5.03
STT3B-202ENST00000423527 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.44■■■■■ 5.02
STT3B-202ENST00000423527 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
STT3B-202ENST00000423527 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
STT3B-202ENST00000423527 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.06■■■■■ 4.96
STT3B-202ENST00000423527 WIZO95785 1651 aa46.01■■■■■ 4.96
STT3B-202ENST00000423527 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.93■■■■■ 4.94
STT3B-202ENST00000423527 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.92■■■■■ 4.94
STT3B-202ENST00000423527 SMARCA2P51531 1590 aa45.85■■■■■ 4.93
STT3B-202ENST00000423527 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.79■■■■■ 4.92
STT3B-202ENST00000423527 NCAPD3P42695 1498 aa45.68■■■■■ 4.9
STT3B-202ENST00000423527 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
STT3B-202ENST00000423527 HMGXB3Q12766 1538 aa45.55■■■■■ 4.88
STT3B-202ENST00000423527 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
STT3B-202ENST00000423527 CCDC88BA6NC98 1476 aa45■■■■■ 4.79
STT3B-202ENST00000423527 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.43■■■■■ 4.7
STT3B-202ENST00000423527 CFTRP13569 1480 aa44.4■■■■■ 4.7
STT3B-202ENST00000423527 NESP48681 1621 aa44.4■■■■■ 4.7
STT3B-202ENST00000423527 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.29■■■■■ 4.68
STT3B-202ENST00000423527 PRDM2Q13029 1718 aa44.16■■■■■ 4.66
STT3B-202ENST00000423527 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.12■■■■■ 4.65
STT3B-202ENST00000423527 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.95■■■■■ 4.63
STT3B-202ENST00000423527 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.94■■■■■ 4.63
STT3B-202ENST00000423527 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.88■■■■■ 4.61
STT3B-202ENST00000423527 ABCC8Q09428 1581 aa43.84■■■■■ 4.61
STT3B-202ENST00000423527 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.77■■■■■ 4.6
STT3B-202ENST00000423527 ERCC6Q03468 1493 aa43.72■■■■■ 4.59
STT3B-202ENST00000423527 TRIM41Q8WV44 630 aa43.61■■■■■ 4.57
STT3B-202ENST00000423527 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.6■■■■■ 4.57
STT3B-202ENST00000423527 SYNJ1O43426 1573 aa43.5■■■■■ 4.55
STT3B-202ENST00000423527 CUX1P39880 1505 aa43.49■■■■■ 4.55
STT3B-202ENST00000423527 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
STT3B-202ENST00000423527 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.48■■■■■ 4.55
STT3B-202ENST00000423527 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
STT3B-202ENST00000423527 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.39■■■■■ 4.54
STT3B-202ENST00000423527 TOPBP1Q92547 1522 aa43.38■■■■■ 4.53
STT3B-202ENST00000423527 TOP2BQ02880 1626 aa43.37■■■■■ 4.53
STT3B-202ENST00000423527 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.36■■■■■ 4.53
STT3B-202ENST00000423527 WDR62O43379 1518 aa43.31■■■■■ 4.52
STT3B-202ENST00000423527 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.15■■■■■ 4.5
STT3B-202ENST00000423527 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
STT3B-202ENST00000423527 CUX2O14529 1486 aa42.96■■■■■ 4.47
STT3B-202ENST00000423527 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.94■■■■■ 4.46
STT3B-202ENST00000423527 SOGA1O94964 1423 aa42.9■■■■■ 4.46
STT3B-202ENST00000423527 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
STT3B-202ENST00000423527 IFT140Q96RY7 1462 aa42.78■■■■■ 4.44
STT3B-202ENST00000423527 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.78■■■■■ 4.44
STT3B-202ENST00000423527 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
STT3B-202ENST00000423527 WDR97A6NE52 1622 aa42.74■■■■■ 4.43
STT3B-202ENST00000423527 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.74■■■■■ 4.43
STT3B-202ENST00000423527 EEA1Q15075 1411 aa42.68■■■■■ 4.42
STT3B-202ENST00000423527 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
STT3B-202ENST00000423527 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
STT3B-202ENST00000423527 KIF27Q86VH2 1401 aa42.54■■■■■ 4.4
STT3B-202ENST00000423527 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.51■■■■■ 4.4
STT3B-202ENST00000423527 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.49■■■■■ 4.391e-6■■■■□ 22.4
STT3B-202ENST00000423527 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.47■■■■■ 4.39
STT3B-202ENST00000423527 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
STT3B-202ENST00000423527 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.43■■■■■ 4.38
STT3B-202ENST00000423527 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.38■■■■■ 4.37
STT3B-202ENST00000423527 PBRM1Q86U86 1689 aa42.31■■■■■ 4.36
STT3B-202ENST00000423527 IGF1RP08069 1367 aa42.27■■■■■ 4.36
STT3B-202ENST00000423527 GRIN2BQ13224 1484 aa42.25■■■■■ 4.35
STT3B-202ENST00000423527 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
STT3B-202ENST00000423527 KIF21BO75037 1637 aa42.21■■■■■ 4.35
STT3B-202ENST00000423527 PRXQ9BXM0 1461 aa42.17■■■■■ 4.34
STT3B-202ENST00000423527 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.13■■■■■ 4.34
STT3B-202ENST00000423527 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.11■■■■■ 4.33
STT3B-202ENST00000423527 GOLGA3Q08378 1498 aa42.06■■■■■ 4.32
STT3B-202ENST00000423527 CUL7Q14999 1698 aa42.06■■■■■ 4.32
STT3B-202ENST00000423527 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
STT3B-202ENST00000423527 ADAMTS12P58397 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
STT3B-202ENST00000423527 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.03■■■■■ 4.32
STT3B-202ENST00000423527 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
STT3B-202ENST00000423527 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.95■■■■■ 4.31
STT3B-202ENST00000423527 SYNJ2O15056 1496 aa41.85■■■■■ 4.29
STT3B-202ENST00000423527 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.83■■■■■ 4.29
STT3B-202ENST00000423527 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
STT3B-202ENST00000423527 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
STT3B-202ENST00000423527 FBLN2P98095 1184 aa41.74■■■■■ 4.27
STT3B-202ENST00000423527 GRIN2AQ12879 1464 aa41.74■■■■■ 4.27
STT3B-202ENST00000423527 CHD1O14646 1710 aa41.74■■■■■ 4.27
STT3B-202ENST00000423527 CEP162Q5TB80 1403 aa41.56■■■■■ 4.24
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