Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WHRNQ9P202 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WHRNQ9P202 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms